התשובה המכריעה לשאלה האם ללמוד הנדסת מכונות במכללה או באוניברסיטה, טמונה בהיצע המוסדות האקדמיים המציעים מסלולים בתחום וכמה מהר המועמדים השכילו להירשם אליהן. בפועל, ישנן 3 אוניברסיטאות המציעות לימודי הנדסת מכונות לתואר ראשון ודיפלומת מהנדס ולעומתן, קיימות 6 מכללות עם תכניות לימודים רלוונטיות: מכללת ספיר המאפשרת ללמוד שנה א' במסגרתה ואז להמשיך בלימודים באוניברסיטת בן גוריון ומכללת שנקר, המציעה לימודי הנדסת פלסטיקה להם קשר מסוים למכונות. מועמדים שהתעכבו בהחלטתם יכולים לגלות כי כל המקומות במחלקות האוניברסיטאיות כבר תפוסים ולכן, המכללות הם הפיתרון היעיל עבורם. כמו כן, מועמדים שהמיקום הגיאוגרפי של מוסד הלימודים לקראת התואר חשוב להם (קרוב או רחוק מהבית, קרוב לעבודה ועוד), יגלו גם במקרה זה שהמכללות הן הפיתרון העדיף עבורם – הן פרוסות בכל רחבי הארץ.
זהו נושא מעט מורכב ותלוי השקפה של כל בוגר, מעסיק ואיש אקדמיה, אך באופן כללי ניתן לומר כי תואר מהנדס בוגר אוניברסיטה הוא עדיין יוקרתי יותר מאשר תואר דומה מטעם מכללה אקדמית. עבור מעסיקים מסוימים זהו פקטור חשוב ואף מהותי בקבלת מועמדים לעבודה ולעיתים, תואר אוניברסיטאי אף מאפשר התקדמות לתפקידים בכירים יותר ומהר יותר. אין ספק כי התכניות להנדסת מכונות במכללות הן איכותיות ורבות מהן אפילו פועלות במסגרת מכללות אקדמיות למקצועות ההנדסה בלבד. אך בשל מוניטין ארוך שנים, השקעה מסיבית במחקר ושאר גורמים, קיים משקל רב יותר לתואר אוניברסיטאי וזהו יתרון שאין להתעלם ממנו.
למועמדים להנדסת מכונות המעוניינים ללמוד במסלול לימודי ערב נחסכה ההתלבטות – האפשרות הרלוונטית מבחינתם היא לימודים במכללה. ישנן 3 מכללות המציעות תכניות לימודי ערב בהנדסת מכונות, בעוד האוניברסיטאות מפעילות מסלול זה רק במסגרות יום מלאות ואינטנסיביות. מסלולי הערב נמשכים באופן טבעי זמן רב יותר (כ – 5 שנים במקום 4) ופריסת הקורסים בהם רחבה יותר.
בדומה למסלולים אקדמיים רבים, תנאי הקבלה לאוניברסיטאות מחמירים וקשים יותר מאשר במכללות האקדמיות. מועמדים בעלי ציון פסיכומטרי גבוה וממוצע בגרויות איכותי, ראוי שיבחרו ללמוד את התחום באוניברסיטה. מן הכיוון השני, בעלי נתוני כניסה טובים פחות יכולים בהחלט להתקבל למכללות וליהנות מתכניות לימוד טובות ומקצועיות.
אוניברסיטאות הן מוסדות אקדמיים אשר נחשבים לנוקשים יותר וגדולים מאוד, אין בהן דגש על יחס אישי לסטודנטים וכיתות הלימוד הן לרוב גדולות. במכללות לעומת זאת, ניתן דגש על יחס אישי ועל כיתות קטנות יותר ועובדה זו מהווה יתרון עבור מועמדים שבוחרים במכללה דווקא בשל הבדלי גישות אלו. הדרישות האקדמיות ותכני הלימוד דומים בין שני סוגי המוסדות, אך הגודל והמהות של המכללות מאפשרים גישה שונה וגמישה יותר להצלחתם של הסטודנטים.
מועמדים אשר יכולים להתקבל לאוניברסיטה ולעמוד בתנאי הלימוד הקשים של מחלקות הנדסת המכונות ירוויחו תואר שעדיין "שווה" יותר בשוק העבודה, תואר הנחשב לאקדמי יותר הכולל תיאוריה, מחקר ופרקטיקה. אוניברסיטאות מציעות תחומי התמחות רבים ומגוונים יותר מאשר במכללות וזה גם עשוי להיות שיקול עבור הסטודנטים. מצד שני, תכניות הלימוד להנדסת מכונות במכללות הן טובות מאוד ובוגריהן משולבים בכל סוגי התפקידים במשק. בנוסף, ישנן מכללות המציעות תחומי התמחות ייחודיים שאין באוניברסיטאות. לכן, השורה התחתונה היא שלימודים באוניברסיטה הם עדיפים – אך ההבדלים מטושטשים מאוד ועבור התוצאה הסופית ההבדל לרוב כלל אינו משמעותי.
